Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRKBQ9Y3C4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPRKBQ9Y3C4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms