Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T4

PPP2R2C, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B gamma isoform, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2CQ9Y2T4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP2R2CQ9Y2T4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP2R2CQ9Y2T4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP2R2CQ9Y2T4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms