Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1DQ9Y2S0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms