Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIKFYVEQ9Y2I7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIKFYVEQ9Y2I7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIKFYVEQ9Y2I7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms