Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CTNND2Q9UQB3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNND2Q9UQB3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNND2Q9UQB3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.3 ms