Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN6Q9UQ52 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN6Q9UQ52 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms