Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNRC6BQ9UPQ9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms