Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP52

TFR2, Transferrin receptor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFR2Q9UP52 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFR2Q9UP52 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TFR2Q9UP52 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms