Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMCC3Q9ULS5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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