Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KCNH3Q9ULD8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNH3Q9ULD8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNH3Q9ULD8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms