Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNMT3LQ9UJW3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT3LQ9UJW3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT3LQ9UJW3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms