Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TSKSQ9UJT2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSKSQ9UJT2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms