Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPS1Q9UHF7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms