Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS7AQ9UBW8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPS7AQ9UBW8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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