Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS3

DNAJB9, DnaJ homolog subfamily B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB9Q9UBS3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB9Q9UBS3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB9Q9UBS3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB9Q9UBS3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB9Q9UBS3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB9Q9UBS3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB9Q9UBS3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB9Q9UBS3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB9Q9UBS3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB9Q9UBS3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB9Q9UBS3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB9Q9UBS3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB9Q9UBS3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB9Q9UBS3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB9Q9UBS3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB9Q9UBS3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms