Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM4

OPTC, Opticin, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTCQ9UBM4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
OPTCQ9UBM4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
OPTCQ9UBM4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms