Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PDP2Q9P2J9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDP2Q9P2J9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms