Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4Q9P0V3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4Q9P0V3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms