Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCMF1Q9P0J7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms