Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM260Q9NX78 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms