Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW6

NMRK1, Nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1Q9NWW6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NMRK1Q9NWW6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NMRK1Q9NWW6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NMRK1Q9NWW6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms