Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLE1Q9NVX2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLE1Q9NVX2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLE1Q9NVX2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms