Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMLHEQ9NVH6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMLHEQ9NVH6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms