Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FBXO28Q9NVF7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO28Q9NVF7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms