Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD2Q9NV79 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCMTD2Q9NV79 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMTD2Q9NV79 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms