Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM106BQ9NUM4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM106BQ9NUM4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM106BQ9NUM4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM106BQ9NUM4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM106BQ9NUM4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM106BQ9NUM4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM106BQ9NUM4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms