Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP8A2Q9NTI2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATP8A2Q9NTI2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATP8A2Q9NTI2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP8A2Q9NTI2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP8A2Q9NTI2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP8A2Q9NTI2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms