Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPMQ9NSP4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPMQ9NSP4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms