Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A13Q9NSD5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A13Q9NSD5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A13Q9NSD5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A13Q9NSD5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A13Q9NSD5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A13Q9NSD5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A13Q9NSD5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A13Q9NSD5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A13Q9NSD5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A13Q9NSD5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A13Q9NSD5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms