Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.948e-15■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 AC011448.1-202ENST00000586674 1071 ntTSL 220.42■□□□□ 0.868e-15■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA13-202ENST00000502506 1166 ntTSL 217.1■□□□□ 0.338e-15■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA13-207ENST00000606722 502 ntTSL 313.82□□□□□ -0.28e-15■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA13-204ENST00000507754 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.348e-15■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-205ENST00000586592 2214 ntTSL 222.95■■□□□ 1.262e-8■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.132e-8■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-211ENST00000590156 1931 ntTSL 215.41■□□□□ 0.062e-8■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.052e-8■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.062e-8■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.762e-8■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.273e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 13e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.723e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.383e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.143e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.343e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRAPPC3-205ENST00000462715 2428 ntTSL 211.56□□□□□ -0.563e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 PTPRA-203ENST00000356147 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.923e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 PTPRA-202ENST00000318266 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.023e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 PTPRA-204ENST00000380393 3636 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.023e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 GYPB-206ENST00000506516 473 ntTSL 1 (best)7.88□□□□□ -1.153e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 GYPB-204ENST00000504951 632 ntTSL 1 (best)6.81□□□□□ -1.323e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.373e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 GYPB-205ENST00000505583 583 ntTSL 1 (best)6.47□□□□□ -1.373e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 GYPB-215ENST00000513677 221 ntTSL 1 (best)6.4□□□□□ -1.383e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 GYPB-208ENST00000507009 388 ntTSL 1 (best)6.4□□□□□ -1.383e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 GYPB-212ENST00000511198 444 ntTSL 1 (best)5.83□□□□□ -1.483e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.53e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 GYPB-211ENST00000510196 508 ntTSL 1 (best)3.18□□□□□ -1.93e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 GYPB-214ENST00000513557 277 ntTSL 1 (best)3.18□□□□□ -1.93e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 GYPB-207ENST00000506679 606 ntTSL 1 (best)2.12□□□□□ -2.073e-6■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 DYNC1H1-204ENST00000555062 1351 ntTSL 219.5■□□□□ 0.711e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.811e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 ARF5-204ENST00000463733 1509 ntTSL 519.3■□□□□ 0.681e-8■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.121e-8■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 FSCN3-204ENST00000478328 705 ntTSL 1 (best)14.58□□□□□ -0.081e-8■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 TRIR-204ENST00000591254 988 ntTSL 228.24■■■□□ 2.116e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.766e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.66e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.66e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.456e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.396e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL37A-207ENST00000478153 2082 ntTSL 1 (best)22.73■■□□□ 1.237e-11■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 CSTB-202ENST00000480147 2344 nt21.01■□□□□ 0.956e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 TRIR-203ENST00000589590 930 ntTSL 220■□□□□ 0.796e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.76e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL37A-201ENST00000359681 742 ntTSL 1 (best)19.32■□□□□ 0.687e-11■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.666e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.276e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.236e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.196e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 CSTB-203ENST00000639959 1855 ntTSL 515.84■□□□□ 0.136e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.16e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.026e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 07e-11■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 07e-11■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 07e-11■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.056e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.056e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2G-203ENST00000525455 919 ntTSL 314.57□□□□□ -0.086e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2G-202ENST00000524819 1053 ntTSL 314.5□□□□□ -0.096e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.16e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 DHX9-202ENST00000473076 1378 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.116e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 PRSS21-206ENST00000574265 860 ntTSL 313.85□□□□□ -0.196e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.226e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.37e-11■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.326e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2G-206ENST00000531944 1556 ntTSL 513.03□□□□□ -0.326e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 MYL12A-207ENST00000579226 947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.456e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.476e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL37A-205ENST00000446558 495 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.57e-11■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.515e-15■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 ECM1-201ENST00000346569 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.586e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RNASE1-204ENST00000412779 896 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.596e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 ECM1-204ENST00000470432 3066 ntTSL 211.31□□□□□ -0.66e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 TRAFD1-202ENST00000412615 2697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.66e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 MYL12A-201ENST00000217652 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.666e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 DHX9-207ENST00000485081 2531 ntTSL 210.88□□□□□ -0.676e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2G-205ENST00000527435 868 ntTSL 210.57□□□□□ -0.726e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RNASE1-201ENST00000340900 878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.746e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL37A-202ENST00000420712 385 ntTSL 510.01□□□□□ -0.817e-11■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 PRSS21-209ENST00000575739 378 ntTSL 39.89□□□□□ -0.836e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RNASE1-203ENST00000397970 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.846e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RNASE1-205ENST00000555698 655 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.856e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL37A-209ENST00000490649 1701 ntTSL 1 (best)9.71□□□□□ -0.857e-11■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 DHX9-201ENST00000367549 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.896e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL37A-208ENST00000487233 2225 ntTSL 29.39□□□□□ -0.917e-11■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL37A-204ENST00000441179 529 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.937e-11■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 BTK-202ENST00000372880 2248 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.046e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 BTK-201ENST00000308731 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.16e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 BTK-210ENST00000621635 2767 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.26e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.217e-11■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2G-204ENST00000526368 710 ntTSL 27.5□□□□□ -1.216e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 DHX9-203ENST00000474446 848 ntTSL 37.04□□□□□ -1.286e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.326e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 TMBIM6-221ENST00000550040 952 ntTSL 25.57□□□□□ -1.526e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 TMBIM6-219ENST00000549471 484 ntTSL 24.93□□□□□ -1.626e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 MYL12A-204ENST00000578038 463 ntTSL 34.77□□□□□ -1.656e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.846e-6■■□□□ 13.7
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