Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSS2Q9NR19 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSS2Q9NR19 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms