Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM10Q9NQV6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM10Q9NQV6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms