Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQE9

HINT3, Histidine triad nucleotide-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINT3Q9NQE9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HINT3Q9NQE9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HINT3Q9NQE9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms