Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMMDC1Q9NPL8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms