Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNPLA8Q9NP80 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms