Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX3

ZNF304, Zinc finger protein 304, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF304Q9HCX3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF304Q9HCX3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF304Q9HCX3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms