Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM27Q9HBJ8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM27Q9HBJ8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms