Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEBOXQ9HB31 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEBOXQ9HB31 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEBOXQ9HB31 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEBOXQ9HB31 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEBOXQ9HB31 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEBOXQ9HB31 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEBOXQ9HB31 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEBOXQ9HB31 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEBOXQ9HB31 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEBOXQ9HB31 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEBOXQ9HB31 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEBOXQ9HB31 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEBOXQ9HB31 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEBOXQ9HB31 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms