Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVMER34-1Q9H9K5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms