Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C10orf88Q9H8K7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms