Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RNF41Q9H4P4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF41Q9H4P4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF41Q9H4P4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms