Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC8Q9H0W5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC8Q9H0W5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms