Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM5Q9C035 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM5Q9C035 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms