Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXQ1Q9C009 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXQ1Q9C009 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXQ1Q9C009 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
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