Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUF2Q9BZD4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUF2Q9BZD4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUF2Q9BZD4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms