Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCRT1Q9BWW7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms