Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWS9

CHID1, Chitinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1Q9BWS9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHID1Q9BWS9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms