Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP8Q9BV40 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms