Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF4Q9BSR8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF4Q9BSR8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms