Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM79Q9BSE2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM79Q9BSE2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM79Q9BSE2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM79Q9BSE2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM79Q9BSE2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM79Q9BSE2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM79Q9BSE2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM79Q9BSE2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM79Q9BSE2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM79Q9BSE2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM79Q9BSE2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms